Cer ist nicht lebensnotwendig und nicht sehr giftig. Es ist das gebräuchlichste der Lanthanoide und Cer-Verbindungen haben eine Vielzahl von Anwendungen. Cer(IV)-oxid wird zum Polieren von Glas verwendet und ist ein wichtiger Bestandteil von Katalysatoren. Ceriummetall wird in Ferroceriumfeuerzeugen wegen seiner pyrophoren Eigenschaften verwendet. Es wird in CRT-Fernsehbildschirmen und Leuchtstofflampen verwendet.
Cer reichert sich nicht nennenswert in der Nahrungskette an. Da es häufig zusammen mit Kalzium in Phosphatmineralien vorkommt, kann sich Cer in geringen Mengen in den Knochen anreichern, was als nicht gefährlich gilt. Arbeiter, die Cer ausgesetzt waren, litten häufig unter Juckreiz, Hitzeempfindlichkeit und Hautläsionen. Cer ist beim Verzehr nicht toxisch.
Wie alle Seltenen Erdmetalle ist Cer von geringer bis mäßiger Toxizität. Als starkes Reduktionsmittel entzündet es sich spontan an der Luft bei 65 bis 80 °C. Dämpfe von Ceriumbränden sind giftig. Wasser sollte nicht verwendet werden, um Ceriumbrände zu löschen, da Cerium mit Wasser reagiert, um Wasserstoffgas zu produzieren.